Avant la mouture, les matières premières subissent un premier nettoyage dans différentes machines dont les principales sont :
- le nettoyeur-séparateur muni de grilles adaptées enlève les particules plus petites et plus grosses que les grains. Le nettoyage effectué par ce nettoyeur-séparateur est plus précis que celui de la réception.
- l'épierreur dont la fonction est d’ôter les pierres du flux de matières premières.
- l'épointeuse pour enlever les impuretés adhérant à l’enveloppe du grain (notamment dans le sillon).
- le trieur à graines rondes.
Chaque machine dispose d’une aspiration pour enlever les particules légères.